229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0431 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0431  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 67 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00281975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2168  putative PAS/PAC sensor protein  61.9 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.242596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1710  putative PAS/PAC sensor protein  60.32 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.010044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1781  putative PAS/PAC sensor protein  60.32 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  65.52 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0298  putative PAS/PAC sensor protein  54.55 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.169835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1202  putative PAS/PAC sensor protein  62.71 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0483  putative PAS/PAC sensor protein  48.48 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000401014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  58.18 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0466  putative PAS/PAC sensor protein  48.48 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.98341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3172  putative PAS/PAC sensor protein  55.17 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.920236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0282  transcriptional regulator  61.54 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.283126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1034  putative PAS/PAC sensor protein  56.9 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  55.74 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  51.72 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4662  PAS  54.39 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0488  putative PAS/PAC sensor protein  58.18 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  55.77 
 
 		 141 aa  66.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3616  putative PAS/PAC sensor protein  52.63 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3803  PAS  56.36 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051055 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3701  putative PAS/PAC sensor protein  56.25 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  48.44 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  58 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  49.12 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6742  putative PAS/PAC sensor protein  49.12 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.63921  normal  0.585827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4485  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0639  putative PAS/PAC sensor protein  51.85 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1568  transcriptional regulator  55.77 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683844  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5581  putative PAS/PAC sensor protein  53.85 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.595222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2802  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.540476  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  69.23 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  51.79 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1206  PAS sensor protein  52.94 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1366  putative PAS/PAC sensor protein  52.94 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0076  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  47.17 
 
 		 898 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  50 
 
 		 705 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2500  putative PAS/PAC sensor protein  48.21 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 502 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 729 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00567966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 		 1085 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1145  putative PAS/PAC sensor protein  47.06 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 620 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.35 
 
 		 728 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0294  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 432 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 		 1183 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 857 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  36.84 
 
 		 732 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  40 
 
 		 1154 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 1171 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9007  two component sensor kinase  50 
 
 		 359 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 907 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.06 
 
 		 821 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 719 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.98 
 
 		 979 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  40.82 
 
 		 980 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.92 
 
 		 1248 aa  48.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 398 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 1313 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 439 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 717 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  44 
 
 		 895 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 		 1193 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.02 
 
 		 921 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 717 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 1721 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 1676 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.59 
 
 		 1348 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 936 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 768 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 768 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 1374 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  46.94 
 
 		 692 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  44.9 
 
 		 771 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 		 621 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  41.67 
 
 		 717 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50 
 
 		 953 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.5 
 
 		 321 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 1171 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 936 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.82 
 
 		 1190 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 768 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 455 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 554 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50 
 
 		 953 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  35.59 
 
 		 683 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.68 
 
 		 1361 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1731  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.82 
 
 		 637 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000986575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 801 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  39.62 
 
 		 947 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000825914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  46 
 
 		 602 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.18 
 
 		 393 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 		 770 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 739 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 		 768 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 717 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 499 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 		 1088 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  38.71 
 
 		 842 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>