More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3701 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3701  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
145 aa  299  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  76.6 
 
 
144 aa  235  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1202  putative PAS/PAC sensor protein  72.86 
 
 
144 aa  225  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  66.67 
 
 
145 aa  207  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1034  putative PAS/PAC sensor protein  67.67 
 
 
158 aa  200  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  53.52 
 
 
151 aa  167  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3172  putative PAS/PAC sensor protein  56.69 
 
 
151 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.920236  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0298  putative PAS/PAC sensor protein  56.06 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.169835  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0483  putative PAS/PAC sensor protein  52.76 
 
 
147 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000401014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0466  putative PAS/PAC sensor protein  52.76 
 
 
147 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.98341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  50.76 
 
 
141 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  47.76 
 
 
145 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6742  putative PAS/PAC sensor protein  51.15 
 
 
143 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.63921  normal  0.585827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  50.38 
 
 
143 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1710  putative PAS/PAC sensor protein  46.04 
 
 
144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.010044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1781  putative PAS/PAC sensor protein  46.04 
 
 
144 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0282  transcriptional regulator  48.46 
 
 
141 aa  142  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.283126  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2168  putative PAS/PAC sensor protein  46.04 
 
 
144 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.242596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3616  putative PAS/PAC sensor protein  46.72 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4662  PAS  48.85 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5581  putative PAS/PAC sensor protein  45.74 
 
 
157 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.595222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  45.74 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  48.44 
 
 
143 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0488  putative PAS/PAC sensor protein  47.01 
 
 
148 aa  133  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1206  PAS sensor protein  48.41 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  49.22 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1366  putative PAS/PAC sensor protein  47.62 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4485  putative PAS/PAC sensor protein  44.7 
 
 
145 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2500  putative PAS/PAC sensor protein  44.36 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  50.89 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  45.8 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2802  putative PAS/PAC sensor protein  43.51 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.540476  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1145  putative PAS/PAC sensor protein  44.19 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0639  putative PAS/PAC sensor protein  43.94 
 
 
142 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1568  transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683844  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3803  PAS  38.84 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 
692 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  35.25 
 
 
732 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.87 
 
 
728 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1374 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  30.95 
 
 
1589 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
499 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
907 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
857 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
1088 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.21 
 
 
1015 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
620 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
501 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1721 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
513 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  30.47 
 
 
495 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
634 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.81 
 
 
1248 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
657 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
515 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.69 
 
 
1348 aa  68.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1085 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
695 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
1158 aa  67.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
543 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.02 
 
 
740 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
851 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.91 
 
 
705 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263072  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
705 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  28.46 
 
 
965 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
534 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
484 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0431  putative PAS/PAC sensor protein  56.25 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00281975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
1676 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.03 
 
 
524 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  29.46 
 
 
823 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
509 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1548 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0076  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.91 
 
 
898 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1313 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1362  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.13 
 
 
862 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.525156  hitchhiker  0.0000167572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1765 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1433 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  28.68 
 
 
1154 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
524 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 
554 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  32.33 
 
 
842 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
630 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
674 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28 
 
 
568 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.17 
 
 
321 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
807 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.75 
 
 
722 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
671 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.143322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  33.03 
 
 
452 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
500 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9007  two component sensor kinase  27.97 
 
 
359 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
979 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.55 
 
 
393 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.16 
 
 
1763 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1731  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28 
 
 
637 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000986575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
457 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
501 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 
1767 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>