109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2339 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  43.86 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3781  hypothetical protein  43.55 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.650876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  39.06 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  48.08 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2902  phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  43.64 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0797  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3752  phage transcriptional regulator, AlpA  41.38 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.433172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0063  hypothetical protein  47.17 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0386  DNA-binding protein, putative  38.46 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0922  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  41.18 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  37.68 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2017  hypothetical protein  45 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.425283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  37.74 
 
 		 71 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  42.86 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  31.82 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  39.62 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  38.98 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  33.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  33.33 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  38.98 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1335  prophage CP4-57 regulatory protein  33.9 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  28.33 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1689  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211878  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0638  phage transcriptional regulator, AlpA  38.64 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  37.74 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2004  transcriptional regulator  38 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 80 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 64 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 81 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 66 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 86 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  36 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0315  prophage CP4-57 regulatory  38.78 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>