108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0941 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3781  hypothetical protein  48.65 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.650876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  51.67 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2902  phage transcriptional regulator, AlpA  49.18 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0386  DNA-binding protein, putative  48.21 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0922  phage transcriptional regulator, AlpA  46.3 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3752  phage transcriptional regulator, AlpA  39.39 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.433172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  40.91 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  44.62 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  48.15 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2017  hypothetical protein  47.54 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.425283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  41.94 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  42.62 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  44.07 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  42.19 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  47.06 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  42.25 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  37.88 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  37.88 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  38.6 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0551  phage transcriptional regulator, AlpA  44.23 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0315  prophage CP4-57 regulatory  44.9 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  38.71 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  45.28 
 
 		 60 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  37.88 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  40.74 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0347  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  39.62 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  45.24 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  41.38 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  38 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  39.22 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  36.92 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  42 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  33.87 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  42 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2993  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1730  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.907409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  35.82 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  32.76 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  34.55 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  44.74 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2289  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398001  hitchhiker  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1320  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.362532  normal  0.0773061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1454  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3376  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.605571 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2092  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2334  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31954  hitchhiker  0.0000000198775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  32.79 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  48.89 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1689  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211878  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  35.71 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0522  phage transcriptional regulator  32.81 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.527959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4141  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0715374  hitchhiker  0.0000772725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>