82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1725 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 74 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  81.16 
 
 		 81 aa  120  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  81.54 
 
 		 69 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  78.46 
 
 		 76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  67.65 
 
 		 81 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  59.7 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  65.45 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  58.06 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  55.93 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  55.93 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  55.93 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  57.63 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  56.45 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  55.93 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  54.69 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  53.12 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  55.36 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  59.62 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  51.61 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  52.38 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  43.94 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  48.08 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  46.15 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  44.23 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  40 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  38.46 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  36.17 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  36.54 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  42.5 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  33.8 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  32.76 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  54.05 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  33.87 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  48.57 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  33.85 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  36.73 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  48.57 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  51.43 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  37.5 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2398  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592161  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  51.43 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  51.43 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  48.57 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  36 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  45.71 
 
 		 72 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  42 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4141  phage transcriptional regulator, AlpA  48.57 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0715374  hitchhiker  0.0000772725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3376  phage transcriptional regulator, AlpA  48.57 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.605571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1320  phage transcriptional regulator, AlpA  48.57 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.362532  normal  0.0773061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2289  phage transcriptional regulator, AlpA  48.57 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398001  hitchhiker  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1454  phage transcriptional regulator, AlpA  48.57 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 77 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 76 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>