33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0616 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  100 
 
 		 81 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  76.39 
 
 		 81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 76 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  69.23 
 
 		 69 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  67.65 
 
 		 74 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  56.34 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  55.93 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  56.9 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  56.6 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  54.39 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  53.45 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  51.72 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  53.45 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  48.44 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  50.88 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  50.88 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  51.92 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  48.61 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  51.92 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  34.78 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 86 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  29.51 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  28.07 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 70 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>