45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0497 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  85.37 
 
 		 95 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  80.72 
 
 		 98 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  76.83 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  66.28 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  63.95 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  60.71 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  60.64 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  60.64 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  61.25 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  60.71 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  53.93 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  57.14 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  58.75 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  57.63 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  55.93 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  54.24 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  51.92 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  41.43 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  39.62 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  35.82 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  37.93 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  33.78 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  33.9 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 64 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 70 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4074  prophage CP4-57 transcriptional regulator protein, AlpA family  37.04 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>