136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_40550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  100 
 
 		 74 aa  150  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  71.23 
 
 		 74 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  52.94 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  46.48 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  44.29 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  45.76 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  43.28 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  44.26 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  44.12 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1935  phage transcriptional regulator, AlpA  41.38 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  48.33 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  46.67 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  41.79 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  43.06 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  42.59 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  45.61 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  46.15 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  46.67 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12531  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 46 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.443841  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  45 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  43.33 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  35.59 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  44.64 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  40.3 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  42.19 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  44.07 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 60 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  44.9 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  41.82 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2878  phage transcriptional regulator, AlpA  35.82 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.891339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1730  phage transcriptional regulator, AlpA  42.37 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.907409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  44.64 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  47.92 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20201  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.508361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  46.94 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  39.66 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  40.35 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  44.9 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  34.85 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  40.32 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  41.38 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  34.85 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3391  prophage CP4-57 regulatory protein  37.29 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  36.36 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0763  AlpA family protein  35.82 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  43.18 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4782  AlpA family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.320716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20231  hypothetical protein  40.43 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  33.82 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4693  AlpA family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  33.82 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 56 aa  43.5  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  35.19 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  46.67 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  43.18 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  40.82 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2092  hypothetical protein  39.34 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  34.85 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  34.85 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  38.71 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  38.18 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  46.67 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2135  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  41.18 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2334  hypothetical protein  39.34 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31954  hitchhiker  0.0000000198775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>