82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003245 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  55.26 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  42.25 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  48.21 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  45.65 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  35.9 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  37.84 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  35.85 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  38.6 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 77 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3333  phage transcriptional regulator, AlpA  44.9 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1696  phage transcriptional regulator, AlpA  34.78 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  34 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4777  hypothetical protein  38.1 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.606513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  34.04 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  38.3 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  37.31 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  34.62 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  40.91 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  32 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  32 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  41.67 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  27.42 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  42.11 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  29.55 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  39.53 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1689  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211878  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  34.88 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  31.82 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  30.99 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  28.3 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1859  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 72 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  39.53 
 
 		 76 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 70 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 65 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5357  AlpA family transcriptional regulator  38 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  34.88 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  32.56 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2092  hypothetical protein  34.04 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2334  hypothetical protein  34.04 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31954  hitchhiker  0.0000000198775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  34.88 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  32.56 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  40.43 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  36.54 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  27.5 
 
 		 64 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  31.82 
 
 		 66 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  31.82 
 
 		 66 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  31.82 
 
 		 66 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>