67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4777 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4777  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.606513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  54.1 
 
 
68 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  53.23 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  53.23 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  53.23 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  53.23 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  54.39 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  52.38 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1696  phage transcriptional regulator, AlpA  52.83 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  53.06 
 
 
72 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2092  hypothetical protein  39.68 
 
 
72 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2334  hypothetical protein  39.68 
 
 
72 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31954  hitchhiker  0.0000000198775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1730  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 
72 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.907409  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  40 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  35.82 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  44.9 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  47.27 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1935  phage transcriptional regulator, AlpA  51.06 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  38.78 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  32.26 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3196  AlpA family transcriptional regulator  35.94 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3391  prophage CP4-57 regulatory protein  35.38 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  40 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1390  phage transcriptional regulator, AlpA  36.11 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 
60 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4782  AlpA family transcriptional regulator  34.38 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.320716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4148  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260842  normal  0.601946 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  30.91 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3140  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0763  AlpA family protein  45.45 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  33.96 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  39.62 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4693  AlpA family transcriptional regulator  45.24 
 
 
57 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  31.82 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 
86 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  29.82 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  32.26 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2878  phage transcriptional regulator, AlpA  30.43 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.891339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  38.1 
 
 
74 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  30 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  30.51 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12531  transcriptional regulator  35.56 
 
 
46 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.443841  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  40.91 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  29.85 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>