120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1062 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 75 aa  156  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  43.08 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  43.08 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  42.65 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  45.76 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  42.86 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  45.76 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  43.94 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 71 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  46.43 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  49.12 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  41.38 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  42.37 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  45.45 
 
 		 71 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  43.33 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  42.59 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  38.71 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  46.43 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1759  phage transcriptional regulator, AlpA  52.27 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2424  hypothetical protein  54.55 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  47.06 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2371  phage transcriptional regulator, AlpA  52.27 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  50.98 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  42.37 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  40.38 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0103  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0118  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  37.25 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  38.78 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4519  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  41.18 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  44.07 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0063  hypothetical protein  44.9 
 
 		 73 aa  48.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  42.55 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1859  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3752  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.433172  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2197  phage transcriptional regulator, AlpA  42.11 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  38.46 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  36.73 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  48.72 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  34.85 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  32.81 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  31.67 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1869  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  31.25 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  31.75 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  31.75 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  34.85 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  30.51 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0922  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  30.99 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  35.48 
 
 		 98 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 86 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 60 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  32.79 
 
 		 76 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>