54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1562 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  51.85 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  65.52 
 
 		 91 aa  85.9  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  38.04 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  44.26 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  46.97 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  47.06 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0052  AlpA family protein  38.1 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  41.18 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  41.18 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  42.11 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0638  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4074  prophage CP4-57 transcriptional regulator protein, AlpA family  36.21 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  41.18 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  33.96 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  38.46 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3999  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  43.86 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  35.29 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2004  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4164  phage transcriptional regulator, AlpA  33.87 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  31.37 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  41.46 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2174  hypothetical protein  40 
 
 		 57 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0062  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 84 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1869  hypothetical protein  36.71 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2070  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  36 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 76 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  35.09 
 
 		 86 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>