20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3251 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  66.18 
 
 		 76 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  70.59 
 
 		 73 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  65.22 
 
 		 64 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  66.67 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  59.09 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  51.52 
 
 		 60 aa  67  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  51.72 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  41.79 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  46.97 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  41.79 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  48 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2725  hypothetical protein  48.21 
 
 		 48 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  39.71 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  35.21 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  27.63 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  48.84 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>