42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2916 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4164  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  45.28 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  42.11 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0052  AlpA family protein  34.92 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4074  prophage CP4-57 transcriptional regulator protein, AlpA family  33.9 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  34.55 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3999  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  26.15 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  44.68 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  29.79 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  31.03 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  36.17 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  39.13 
 
 		 88 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4137  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 124 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  hitchhiker  0.000000411307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  29.79 
 
 		 60 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  40.38 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  29.79 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.64 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  32.56 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.64 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  34.55 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  31.91 
 
 		 65 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  31.25 
 
 		 95 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  29.82 
 
 		 98 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 68 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>