38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0999 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 57 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0638  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  40.74 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  43.75 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  40.74 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  45.65 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1759  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3119  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000632591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 61 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2371  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 87 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  38.64 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  39.53 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  34.04 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  32.56 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>