17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2070 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  66.18 
 
 		 77 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  61.76 
 
 		 73 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  63.24 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  57.35 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  50.72 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  50 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  39.73 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  42.65 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  37.88 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  53.06 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  43.08 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  41.79 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  48.78 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  40.32 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2725  hypothetical protein  39.29 
 
 		 48 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>