27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0638 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0638  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 66 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720576 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  42.59 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3544  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.473162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1081  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  39.06 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 76 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  31.03 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  40 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2004  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  33.96 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  48.98 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  44.19 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3394  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  38.64 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0052  AlpA family protein  34.38 
 
 		 72 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4459  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 58 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.744245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2197  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  32.26 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2174  hypothetical protein  43.18 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>