101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2390 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  100 
 
 		 78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  63.01 
 
 		 76 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  64.91 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  49.06 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  48 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  34.43 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  37.7 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  35.82 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0638  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  34.43 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  32.79 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  30.91 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  36.54 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  42 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  32.79 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  39.22 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  31.15 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 80 aa  48.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3698  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  38.89 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  35.19 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  34.43 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0242  phage transcriptional regulator, AlpA  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.88011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  27.42 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  31.15 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  36.36 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  41.18 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.31 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3994  phage transcriptional regulator, AlpA  29.31 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.273173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  31.67 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  36 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  35.82 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  29.82 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1696  phage transcriptional regulator, AlpA  29.51 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  39.22 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  29.82 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  29.82 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  30 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  29.82 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0868  prophage regulatory protein AlpA  32.79 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0624005  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0152  phage transcriptional regulator, AlpA  32.84 
 
 		 380 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 73 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  29.63 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  28.07 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  32.84 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  28 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2358  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201012  normal  0.0278403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  27.94 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  32.76 
 
 		 79 aa  40  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12531  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 46 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.443841  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2364  phage transcriptional regulator, AlpA  34.15 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>