23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2647 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 99 aa  193  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  38.04 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  41.18 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  40.3 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  42.25 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  39.71 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4164  phage transcriptional regulator, AlpA  34.09 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0052  AlpA family protein  37.5 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0062  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  46.15 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  41.27 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3999  phage transcriptional regulator, AlpA  40.28 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4074  prophage CP4-57 transcriptional regulator protein, AlpA family  39.39 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  40.32 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2070  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  47.62 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 77 aa  40.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  40.54 
 
 		 75 aa  40.8  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2004  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  34.04 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>