15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1869 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1869  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  65.67 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2424  hypothetical protein  50.68 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1759  phage transcriptional regulator, AlpA  53.97 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2371  phage transcriptional regulator, AlpA  53.97 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  51.61 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0103  hypothetical protein  66.67 
 
 		 56 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0118  hypothetical protein  66.67 
 
 		 56 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  44.62 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  35.94 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5243  hypothetical protein  34.21 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  36.71 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4519  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>