24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4074 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4074  prophage CP4-57 transcriptional regulator protein, AlpA family  100 
 
 		 67 aa  137  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0052  AlpA family protein  77.78 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3999  phage transcriptional regulator, AlpA  72.58 
 
 		 73 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4119  hypothetical protein  59.02 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0315735  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4164  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  33.9 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  32.76 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  39.39 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2004  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  29.82 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  40.48 
 
 		 71 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  34.92 
 
 		 98 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  37.25 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  33.85 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  29.69 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 75 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 109 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>