20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2796 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 109 aa  226  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  39.71 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  38.89 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  48.98 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1437  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  45.65 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4164  phage transcriptional regulator, AlpA  46.15 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5357  AlpA family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0868  prophage regulatory protein AlpA  32.89 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0624005  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2579  hypothetical protein  37.04 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556103  hitchhiker  0.0000472514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2613  hypothetical protein  37.04 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031562  hitchhiker  0.0000000000000109631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0052  AlpA family protein  32.79 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3119  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000632591  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3698  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  39.62 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 79 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 76 aa  40.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17020  Prophage CP4-57 regulatory , AlpA-like protein  31.03 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4074  prophage CP4-57 transcriptional regulator protein, AlpA family  30.77 
 
 		 67 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>