19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2991 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  146  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  70.59 
 
 		 77 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  61.76 
 
 		 76 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  67.65 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  53.62 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  47.76 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  53.85 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  46.67 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  44.12 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  49.09 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2725  hypothetical protein  41.38 
 
 		 48 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  37.14 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  36.23 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  30.3 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  39.53 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>