53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3167 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 72 aa  144  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  52.08 
 
 		 60 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  44.12 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  55.77 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  57.5 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  53.06 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  48 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  45.28 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2725  hypothetical protein  51.28 
 
 		 48 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2398  Phage transcriptional regulator, AlpA  34.43 
 
 		 103 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592161  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 73 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  42.11 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  45.28 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  35.48 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  37.25 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  42.31 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  37.25 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  42.55 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  39.13 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  38.89 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  38.89 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 76 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  48.72 
 
 		 67 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  34.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  35.29 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3119  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000632591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>