19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1625 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 77 aa  156  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  59.18 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  46.67 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  37.14 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  57.5 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  51.16 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  39.06 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  37.88 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  49.15 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  40.68 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  48.78 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3119  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000632591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  42.5 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 99 aa  40.8  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2725  hypothetical protein  43.33 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  41.86 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>