13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2424 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2424  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1759  phage transcriptional regulator, AlpA  86.21 
 
 		 109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2371  phage transcriptional regulator, AlpA  86.21 
 
 		 87 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0103  hypothetical protein  74.07 
 
 		 56 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0118  hypothetical protein  74.07 
 
 		 56 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1869  hypothetical protein  50.68 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  62.3 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  54.55 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  42.37 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5243  hypothetical protein  31.25 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  46.81 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>