51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2218 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 
99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  63.75 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  65 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  65 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  65 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  65.52 
 
 
98 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  64.56 
 
 
117 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  68.35 
 
 
136 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  63.75 
 
 
129 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  62.79 
 
 
127 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  67.09 
 
 
127 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  59.77 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  58.75 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  56.18 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  54.24 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  54.69 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  59.62 
 
 
74 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  54.55 
 
 
76 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  48.1 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  50 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  54.17 
 
 
76 aa  60.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 
76 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  37.31 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  41.82 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  37.74 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2398  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592161  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  31.48 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  31.48 
 
 
103 aa  43.5  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 
57 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  37.04 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  30.99 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 
67 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0063  hypothetical protein  40.82 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 
77 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 
69 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>