81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1859 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1859  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  71.19 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  71.93 
 
 		 88 aa  90.5  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4519  phage transcriptional regulator, AlpA  63.93 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.84 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  39.19 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  44.83 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  48.98 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  38.1 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  40 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  33.87 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  32.26 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  44.9 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  32.81 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  39.58 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  31.34 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  31.25 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  32.47 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  31.58 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  30.36 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  29.69 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  42.19 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  36.54 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  40.91 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  42.22 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  36.54 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  28.07 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  36.73 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  35.19 
 
 		 65 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  32.65 
 
 		 103 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  36.76 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  32.84 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  35.29 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3994  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.273173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  31.03 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3333  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>