20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1597 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 57 aa  116  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1065  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1087  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  38.89 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1859  phage transcriptional regulator, AlpA  40.91 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 60 aa  40  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 74 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>