45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0279 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  100 
 
 		 72 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 56 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  30 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0063  hypothetical protein  38.78 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  28 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  32 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1087  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1065  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  31.25 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  32 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3333  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  28.3 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3119  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000632591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 68 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  30 
 
 		 62 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  34.04 
 
 		 81 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1859  phage transcriptional regulator, AlpA  28.07 
 
 		 143 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  30.91 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  24.53 
 
 		 87 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  24 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  34.09 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2398  Phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 103 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592161  normal  0.404854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>