23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3333 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3333  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 74 aa  153  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  52 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  44.9 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  33.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3238  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00555486  normal  0.294063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0063  hypothetical protein  35.48 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4137  phage transcriptional regulator, AlpA  43.9 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  hitchhiker  0.000000411307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  37.7 
 
 		 81 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  30.65 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1859  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 66 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  28.85 
 
 		 71 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>