19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3238 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3238  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 96 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00555486  normal  0.294063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1915  prophage CP4-57 regulatory protein  52.17 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.317133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3544  phage transcriptional regulator, AlpA  47.76 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4137  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  hitchhiker  0.000000411307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  33.9 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  32.43 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3333  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2682  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000942053  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  32.73 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20201  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 65 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.508361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>