65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01121 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  55.26 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  37.97 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  34.18 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1696  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  37.7 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  41.79 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  31.75 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  40.43 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  31.67 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  40.43 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  42 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  38.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  39.53 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  38.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  32.26 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  30.36 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2092  hypothetical protein  33.9 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2334  hypothetical protein  33.9 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31954  hitchhiker  0.0000000198775 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  38.64 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4777  hypothetical protein  39.62 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.606513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  29.03 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  29.31 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  27.87 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  40.43 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  34.04 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  28.07 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 56 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  47.37 
 
 		 88 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  34.04 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3333  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 74 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  33.8 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  31.67 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  29.79 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  29.79 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  30.23 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3818  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>