31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0922 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0922  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3752  phage transcriptional regulator, AlpA  69.33 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.433172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0315  prophage CP4-57 regulatory  53.33 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  59.26 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0347  phage transcriptional regulator, AlpA  46.67 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0386  DNA-binding protein, putative  55.77 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2902  phage transcriptional regulator, AlpA  55.93 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3781  hypothetical protein  57.14 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.650876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0551  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  45.1 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2017  hypothetical protein  44.64 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.425283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  32.05 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  35.9 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  32.08 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>