29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2371 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1759  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 109 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2371  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 87 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2424  hypothetical protein  86.21 
 
 		 87 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0118  hypothetical protein  76.79 
 
 		 56 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0103  hypothetical protein  76.79 
 
 		 56 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  65.57 
 
 		 86 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1869  hypothetical protein  56.52 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  54.69 
 
 		 65 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  48.39 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  52.27 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  51.06 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5243  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  32.84 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  31.82 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  36.21 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  32.76 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  30.51 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>