23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2482 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 87 aa  180  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  45.83 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  35.44 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  35.8 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  42.25 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1045  phage transcriptional regulator, AlpA  38.96 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  41.79 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3818  hypothetical protein  35.14 
 
 		 95 aa  50.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2832  phage transcriptional regulator, AlpA  32.86 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0794496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  25.42 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  30.51 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  35.85 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  29.09 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  25.93 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  30 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  32.65 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>