28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2857 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 87 aa  176  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  36.99 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  35.44 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  37.97 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  42.68 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  37.84 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  40.62 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1045  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2364  phage transcriptional regulator, AlpA  41.38 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  35 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2832  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0794496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 56 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  36.99 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  32.84 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3818  hypothetical protein  37.88 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  36.36 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>