21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2832 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2832  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 121 aa  249  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0794496  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1045  phage transcriptional regulator, AlpA  60.81 
 
 		 80 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  58.11 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  48.65 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3818  hypothetical protein  52.38 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  56.25 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  44.64 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  43.1 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  32.86 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  35.53 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  31.67 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 67 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  40.35 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>