31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2745 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 92 aa  186  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  45.83 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  36.99 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  47.17 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3818  hypothetical protein  40.28 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  38.75 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  38.67 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1045  phage transcriptional regulator, AlpA  34.72 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2832  phage transcriptional regulator, AlpA  35.53 
 
 		 121 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0794496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  44.26 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  39.62 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  39.62 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  40.68 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  36.54 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4777  hypothetical protein  34.69 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.606513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  28.57 
 
 		 65 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>