82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1935 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1935  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  47.27 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  46.55 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  41.38 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2878  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.891339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  40.62 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0763  AlpA family protein  40.35 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4782  AlpA family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.320716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  47.73 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  47.37 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3391  prophage CP4-57 regulatory protein  37.93 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4777  hypothetical protein  51.06 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.606513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  40.74 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4693  AlpA family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3196  AlpA family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  42.86 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  46.94 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12531  transcriptional regulator  42.22 
 
 		 46 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.443841  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  46.51 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  45 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  41.86 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3140  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3994  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.273173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  47.83 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  42.22 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  40.68 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  37.5 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  41.67 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  42.86 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  42 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4887  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  37.25 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2135  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  37.25 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  37.93 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  39.58 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  36.73 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  30.88 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  39.58 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  39.58 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  39.53 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  39.53 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  39.53 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  32.65 
 
 		 66 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1076  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  37.25 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.154592 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2530  phage transcriptional regulator, AlpA  31.25 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1390  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0868  prophage regulatory protein AlpA  35.48 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0624005  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1618  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.939169  normal  0.0191928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  35.71 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2205  Phage AlpA family protein  33.33 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  39.58 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  41.03 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  32 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0240  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  40.82 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4148  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260842  normal  0.601946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>