43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1390 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1390  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 70 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2878  phage transcriptional regulator, AlpA  70.59 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.891339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2135  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  67.16 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4887  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  67.16 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1076  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  70.15 
 
 		 68 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.154592 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0763  AlpA family protein  62.32 
 
 		 69 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3140  phage transcriptional regulator, AlpA  61.76 
 
 		 68 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4782  AlpA family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.320716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3196  AlpA family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 78 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3391  prophage CP4-57 regulatory protein  62.3 
 
 		 76 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4693  AlpA family transcriptional regulator  66.04 
 
 		 57 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  32.84 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4777  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.606513  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  47.06 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2530  phage transcriptional regulator, AlpA  29.31 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  36.76 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  32.84 
 
 		 95 aa  44.3  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  29.23 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  29.23 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  35 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3994  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.273173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  29.69 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1935  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2092  hypothetical protein  33.9 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2334  hypothetical protein  33.9 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31954  hitchhiker  0.0000000198775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  30.51 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  32.2 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0522  phage transcriptional regulator  29.41 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.527959  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  42.11 
 
 		 69 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4148  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 55 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260842  normal  0.601946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1730  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 72 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.907409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>