34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1131 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 69 aa  137  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0763  AlpA family protein  34.92 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2878  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.891339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3119  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000632591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2725  hypothetical protein  42.5 
 
 		 48 aa  43.5  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  39.13 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3140  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  30.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  32.14 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4782  AlpA family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.320716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3196  AlpA family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3391  prophage CP4-57 regulatory protein  32.73 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4693  AlpA family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 57 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3994  phage transcriptional regulator, AlpA  30.16 
 
 		 78 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.273173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  31.03 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  30 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0522  phage transcriptional regulator  31.25 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.527959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1390  phage transcriptional regulator, AlpA  42.11 
 
 		 70 aa  40  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4887  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  34.78 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2135  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  34.78 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5085  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 89 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>