60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0522 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0522  phage transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.527959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  44.23 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3376  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.605571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2289  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398001  hitchhiker  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1320  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.362532  normal  0.0773061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1454  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4141  phage transcriptional regulator, AlpA  33.87 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0715374  hitchhiker  0.0000772725 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3196  AlpA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4782  AlpA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.320716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3391  prophage CP4-57 regulatory protein  37.5 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4148  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260842  normal  0.601946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  38.98 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2993  Phage transcriptional regulator, AlpA  34.72 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2197  phage transcriptional regulator, AlpA  30.99 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3994  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.273173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  36.99 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2648  Prophage CP4-57 regulatory  34 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  34 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3140  phage transcriptional regulator, AlpA  32.65 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0763  AlpA family protein  31.37 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2878  phage transcriptional regulator, AlpA  31.03 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.891339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  29.17 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4693  AlpA family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4887  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  25.4 
 
 		 92 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  45.65 
 
 		 73 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2135  prophage CP4-57 regulatory protein AlpA  25.4 
 
 		 92 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  39.22 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  39.22 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  31.25 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2530  phage transcriptional regulator, AlpA  28 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1390  phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  39.22 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 76 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 69 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>