108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001834 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 62 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  37.74 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  34.43 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  40.74 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  31.67 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  39.62 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  34.55 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  32.76 
 
 		 71 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2993  Phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  36.36 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  35.29 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 86 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  31.03 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  30.91 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  31.03 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2205  Phage AlpA family protein  44 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  29.63 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1454  phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4141  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0715374  hitchhiker  0.0000772725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1915  prophage CP4-57 regulatory protein  30.77 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.317133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  31.58 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3376  phage transcriptional regulator, AlpA  29.63 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.605571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2289  phage transcriptional regulator, AlpA  29.63 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398001  hitchhiker  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1320  phage transcriptional regulator, AlpA  29.63 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.362532  normal  0.0773061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  35.85 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  31.58 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  43.24 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  29.09 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  29.09 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  39.47 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20201  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.508361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  27.27 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  39.47 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  40.54 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 128 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  27.78 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  29.63 
 
 		 75 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  31.67 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  30.91 
 
 		 86 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  30.91 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  30.91 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  30.91 
 
 		 66 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 75 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  34.69 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  27.78 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>