52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0353 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  87.69 
 
 		 81 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  81.54 
 
 		 74 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  69.23 
 
 		 81 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  56.92 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  60 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  60.32 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  54.69 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  57.63 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  55.38 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  55.17 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  52.17 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  54.24 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  51.43 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  54.69 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  54.69 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  55.17 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  56.14 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  42.37 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  44.23 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  33.85 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  36.73 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  44.23 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  40.91 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  32.26 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  40.48 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 65 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  47.5 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>