47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2652 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  156  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  71.05 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  76.92 
 
 		 69 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  78.46 
 
 		 74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  69.01 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  60.29 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  61.82 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  53.85 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  56.9 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  56.9 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  54.84 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  50.85 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  48.53 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  48.44 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  54.55 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  48.39 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  48.33 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  47.83 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  41.38 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  45.61 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  35.48 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  36.54 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  40.35 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  35.94 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 73 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  29.51 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  43.48 
 
 		 88 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  28.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  32.61 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  28.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  31.58 
 
 		 88 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 71 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>