38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0340 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 75 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2364  phage transcriptional regulator, AlpA  37.68 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  44.64 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  45.45 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  36.23 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  39.29 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  39.66 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  37.93 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 86 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  38.89 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  53.85 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  37.1 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  33.85 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  54.84 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  43.9 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1618  phage transcriptional regulator, AlpA  32.31 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.939169  normal  0.0191928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>