54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20201 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20201  transcriptional regulator  100 
 
 		 65 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.508361 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20231  hypothetical protein  98.46 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  43.18 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0668  hypothetical protein  39.13 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778257  hitchhiker  0.000000528136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  39.13 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  42.55 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  34.78 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  34.78 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  40.91 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  37.78 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  37.21 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  41.46 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  34.78 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  38.1 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  36.96 
 
 		 60 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0868  prophage regulatory protein AlpA  40.82 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0624005  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  38.46 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  39.53 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  38.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  38.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12531  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 46 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.443841  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  39.53 
 
 		 64 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  34.88 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  31.82 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  34.15 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  41.03 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  39.02 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  31.11 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4519  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  29.55 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  30.23 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  29.55 
 
 		 86 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3238  phage transcriptional regulator, AlpA  39.02 
 
 		 96 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00555486  normal  0.294063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>