15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1915 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1915  prophage CP4-57 regulatory protein  100 
 
 		 80 aa  163  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.317133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3238  phage transcriptional regulator, AlpA  52.17 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00555486  normal  0.294063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4137  phage transcriptional regulator, AlpA  50.7 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  hitchhiker  0.000000411307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3544  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  32.69 
 
 		 87 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  46.81 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>