68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0868 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0868  prophage regulatory protein AlpA  100 
 
 		 93 aa  195  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0624005  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1618  phage transcriptional regulator, AlpA  73.49 
 
 		 83 aa  130  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.939169  normal  0.0191928 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2358  phage transcriptional regulator, AlpA  50.77 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201012  normal  0.0278403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  43.1 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1051  phage transcriptional regulator, AlpA  44.07 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  47.62 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1689  phage transcriptional regulator, AlpA  55.32 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211878  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  37.84 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  37.84 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17020  Prophage CP4-57 regulatory , AlpA-like protein  38.16 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  42.19 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  32.35 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  37.18 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  34.38 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  43.08 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  42.19 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  32.35 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  35.82 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  48.21 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  36.62 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  38.1 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3698  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  42.37 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  34.38 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  32.89 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  34.38 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  32.14 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  32.31 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  34.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20201  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.508361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  32.79 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  35.94 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1335  prophage CP4-57 regulatory protein  35 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  36.51 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 81 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 68 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  30.67 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1935  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  34.92 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  31.25 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  34.38 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20231  hypothetical protein  40.82 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0152  phage transcriptional regulator, AlpA  31.82 
 
 		 380 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  31.15 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  31.75 
 
 		 71 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  31.75 
 
 		 71 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>